Warren grał w koszykówkę w college’u na Uniwersytecie Kalifornijskim w Los Angeles, gdzie przez trzy lata był pisarzem na uniwersytecie i początkowym obrońcą od 1966 do 1968. Pod wodzą Lwa Alcindora drużyna Bruins osiągnęła rekordy 30–0 w 1967 r. i 29–1 w 1968 r. Obie drużyny były trenerami legendarnego trenera Johna Woodena zdobył mistrzostwo kraju NCAA. Warren, najmniejszy starter Bruinsa, mierzący 1,80 m, miał średnio 12,4 punktu jako junior w 1967 r. Został powołany do drużyny All-Tournament NCAA, a w 1968 był zawodnikiem All-American, jednym z trzech w drużynie na UCLA wraz z Alcindorem i strażnikiem Luciusem Allenem. Zespół uważany jest za jeden z najlepszych w historii koszykówki uczelni. Warren zdobył także nagrodę jako najlepszy obrońca Bruins w 1966 i zdobył tę nagrodę jako najlepszy „gracz zespołowy” Bruins w latach 1967–1968.