Druga dywizja również funkcjonowała z przerwami, aż do jego ponownego utworzenia w 1986 roku, a trzecia dywizja została utworzona w 1993 roku.
Scottish Women's League (SWL) została utworzona przez SWFA 9 listopada 1999 roku, nazwa najwyższej ligi została przemianowana na Premier Division. W 2002 roku Premier Division oddzieliła się, tworząc Scottish Women's Premier League (SWPL). W 2016 roku SWPL utworzyła drugą dywizję, degradując dywizje SWL o jeden poziom w dół na trzeci stopień piramidy piłkarskiej. W sezonie 2023/24 dywizje SWF zostały zintegrowane z piramidą. Highlands and Islands Women's League została założona w 2019 roku przez Scottish Women's Football (SWF) i zajmuje piątą poziom w hierarchii ligowej, bez możliwości promocji do SWL. Od 2002 roku liga była zarządzana przez Scottish Women's Football. Administracja SWPL została przejęta przez Scottish Football Association w 2007 roku, a następnie przez Scottish Professional Football League w 2022 roku.