Po deportacji do obozu zagłady w Treblince, zginęła jego 34-letnia żona Rachela, z d. Rozenblum, i 3-letnia córeczka Jehudit (w Treblince został także zamordowany brat Racheli, lekarz Izrael Rozenblum). W obozie, Izrael Sudowicz pracował jako ogrodnikEdward Kopówka – Treblinka nigdy więcej (Muzeum Regionalne w Siedlcach, 2014; ISBN:83−88761−15−3) s. 40, a jego wiedzę wykorzystywano w ogrodzie warzywnym w północno-wschodnim narożniku obozu.
Należał do członków założycieli Komitetu Organizacyjnego, powołanego na przełomie lutego i marca 1943 roku przez grupę więźniów „dolnego obozu” i stanowiącego zaczątek obozowej konspiracji. Po aresztowaniu Juliana Chorążyckiego, znalazł się w odnowionym Komitecie Organizacyjnym, liczącym około dziesięciu członków (ze starego składu oprócz Sudowicza, pozostali jedynie Kurland i Salzberg). Wkrótce w szeregi konspiracji zaczęto werbować nowych członków, na skutek czego w lipcu 1943 roku jej liczebność sięgnęła około 60 osób.