W lipcu 2021 roku Grabowski objął III-ligowe Podhale Nowy Targ. Mimo że nie udało mu się awansować, zdobył uznanie, prowadząc drużynę do piątego miejsca w lidze. Jego osiągnięcia zaowocowały ofertą prowadzenia klubu II ligi – Stomilu Olsztyn. Pod jego wodzą Stomil dotarł do finału baraży o awans w sezonie 2022/2023. W decydującym meczu drużyna przegrała z Motorem Lublin po rzutach karnych, ale Grabowski zyskał uznanie za pozytywny wpływ na zespół, co przyciągnęło uwagę klubów z wyższych lig.
14 czerwca 2023 roku Grabowski został mianowany trenerem Lechii Gdańsk, która właśnie spadła do I ligi. Klub wykupił jego kontrakt, a Grabowski w pierwszym sezonie poprowadził Lechię do awansu do Ekstraklasy po zwycięstwie 4:3 nad Wisłą Kraków 11 maja 2024 roku. Osiem dni później Lechia zdobyła mistrzostwo I ligi, wygrywając 2:1 w Derbach Trójmiasta z Arką Gdynia. 23 listopada 2024 Lechia wydała komunikat, że Grabowski został zawieszony w pełnieniu obowiązków trenera. Cztery dni później klub rozwiązał z nim umowę.
19 maja 2025 został ogłoszony nowym trenerem ŁKS-u Łódź od sezonu 2025/2026, podpisując kontrakt do końca czerwca 2027 r.