Podczas kampanii wrześniowej zgodnie z rozkazem ewakuował się wraz ze swoją eskadrą w kierunku Puław, następne etapy ewakuacji to Lublin, Chełm i dalej w kierunku granicy z Rumunią. W mieście Dolina dostał się do niewoli niemieckiej. Jako jeniec wojenny został skierowany do obozu dla oficerów Oflag VII A Murnau na terenie Niemiec (jeniec nr. 15764, od 20 września 1939)dokument wymienia omyłkowo nazwisko Siewirski Tadeusz, pozostałe dane zgodne z danymi Tadeusza Siewierskiego,. W obozie dokształcał się, brał udział w tajnych kursach wojskowych oraz ekonomii. Po wyzwoleniu obozu przez oddziały amerykańskiej armii i zakończeniu wojny w 1945 roku powrócił do Polski. W grudniu 1945 zgłosił się do lotnictwa wojskowego Ludowego Wojska Polskiego, dostał przydział na stanowisko dowódcy 3. Eskadry Lotniczej w 3 Pułku Lotnictwa Myśliwskiego.