Augustin Misago (ur. 1943 w Ruvune, zm. 12 marca 2012 w Gikongoro) – rwandyjski duchowny rzymskokatolicki, biskup Gikongoro.
Biografia 25 lipca 1971 otrzymał święcenia prezbiteriatu.
30 marca 1992 papież Jan Paweł II mianował go biskupem powstałej tego samego dnia diecezji Gikongoro. 28 czerwca 1992 przyjął sakrę biskupią z rąk prefekta Kongregacji ds. Ewangelizacji Narodów kard. Jozefa Tomko. Współkonsekratorami byli biskup Butare Jean-Baptiste Gahamanyi oraz biskup Byumby Joseph Ruzindana.
Uwięzienie i proces W kwietniu 1999 prezydent Rwandy Pasteur Bizimungu publicznie oskarżył go odpowiedzialność za masakrę Tutsich z 19 kwietnia 1994, dokonaną w czasie ludobójstwa w Rwandzie. 14 kwietnia 1999 bp Misago został aresztowany i kolejny rok spędził w więzieniu, w humanitarnych warunkach. Był on najwyżej postawionym przedstawicielem Kościoła katolickiego oskarżonym w związku z ludobójstwem w Rwandzie.
W 2000 odbył się jego proces przed specjalną izbą sądu w Kigali. Oskarżono go o spiskowanie w celu zorganizowania rzezi Tutsich, uczestniczenie w niej, nieudzielenie pomocy i gwałt. Prokurator zażądał kary śmierci.