Jan Józef Rafalski (ur. 1 kwietnia 1909 w Petersburgu, zm. 1995) – polski arachnolog-akarolog, profesor zwyczajny.
Życiorys Ukończył gimnazjum w Poznaniu w 1928 roku. Studiował na Uniwersytecie Poznańskim, jego nauczycielami byli m.in. Antoni Jakubski oraz Jan Gabriel Grochmalicki. Tytuł magistra uzyskał w 1939 roku. Na stopień podporucznika rezerwy został mianowany ze starszeństwem z 1 stycznia 1935 i 37. lokatą w korpusie oficerów piechoty.
Walczył w kampanii wrześniowej, trafił do obozu jenieckiego.
W latach 50. XX wieku był samodzielnym pracownikiem nauki w Katedrze Zoologii Ogólnej Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza w Poznaniu, która mieściła się w Collegium Maius. W grudniu 1955 roku otrzymał nagrodę pieniężną ministra. Uzyskał stopień doktora. Pracował na stanowisku docenta w Zakładzie Morfologii Zwierząt Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza, był w latach 70. XX wieku jego kierownikiem. Następnie pracował na stanowisku profesora nadzwyczajnego i profesora zwyczajnego; w 1989 roku był pracownikiem emerytem. Mieszkał w Poznaniu na os.