W listopadzie 2024 roku Konferencja Duchownych Diecezji Katowickiej wytypowała ks. Wojciecha Prackiego jako kandydata duchownych w wyborach zwierzchnika diecezji. 30 listopada 2024 Synod Wyborczy Diecezji Katowickiej Kościoła Ewangelicko-Augsburskiego w Polsce obradujący w Bytomiu-Miechowicach wybrał ks. Wojciecha Prackiego na urząd biskupa diecezji katowickiej. W tajnym głosowaniu ks. Wojciech Pracki zdobył 62 głosów „za”, 10 „przeciw” i 11 „wstrzymujących się”.
Konsekracja biskupa oraz wprowadzenie w urząd biskupa diecezjalnego Diecezji Katowickiej odbyła się w kościele Zmartwychwstania Pańskiego w Katowicach 1 lutego 2025. Konsekratorem był zwierzchnik Kościoła bp Jerzy Samiec, w asyście bpa Adriana Korczagi – zwierzchnika diecezji cieszyńskiej i bpa Mariana Niemca – byłego zwierzchnika diecezji katowickiej Kościoła.
Jest aktywny w lokalnym środowisku ekumenicznym. Współpracuje z Radiem Opole i katolickim Radiem Doxa. Jako nowy ewangelicki biskup katowicki, w wywiadzie dla katowickiego Radia eM, podkreślał znaczenie dialogu ekumenicznego i obecności Kościoła w mediach. Nadal mieszka w Opolu i równocześnie kieruje tamtejszą parafią ewangelicką.