Przed 2. rundą i 1/8 finału przeprowadzono losowanie wyłaniające pary meczowe. W 2. rundzie drużyny, które awansowały z 1. rundy, dolosowywane były (o ile to możliwe) do zespołów z extraligi, natomiast w ćwierćfinałach zespoły, które awansowały z 1/8 finału do półfinalistów Pucharu Czech w sezonie 2023/2024. Losowanie par 2. rundy odbyło się 20 września, natomiast 1/8 finału, ćwierćfinałów i półfinałów – 8 października.
Gospodarzami meczów w 2. rundzie i 1/8 finału były zespoły nierozstawione. W ćwierćfinałach gospodarzami pierwszych meczów były drużyny nierozstawione.
Drużyny uczestniczące W Pucharze Czech w sezonie 2024/2025 uczestniczyły 32 drużynyLista drużyn uczestniczących w Pucharze Czech od 2. rundy: . ČEZ extraliga(13 drużyn)Aero Odolena VodapółfinałBlack Volley BeskydyćwierćfinałKladno volejbal.czćwierćfinałSKV Ústí nad Labem1/8 finałuVK Benátky nad Jizerou2. rundaVK ČEZ KarlovarskofinałVK Dukla Liberec1/8 finałuVK Jihostroj České BudějovicepółfinałVK Lvi PrahazwycięstwoVK OstravaćwierćfinałVK Trox Příbram1/8 finałuVolejbal Brno1/8 finałuVSC Fatra Zlín2. runda 1. liga(10 drużyn)Black Volley Beskydy B1. rundaSK Kojetín 20162. rundaSK Volejbal Kolín2. rundaTJ Holubice2. rundaTJ Slavia Hradec KrálovéćwierćfinałTJ Sokol Bučovice2. rundaTJ Sokol Dobřichovice1. rundaTJ Spartak Velké Meziříčí1.