Aresztowanie i śmierć W 1943 roku Lesikowski nawiązał kontakt z AK. Zdaniem Jędrzejewskiego miało to mieć miejsce w połowie marca. Od kwietnia w mieszkaniu Lesikowskiego w Kościerzynie odbywały się rozmowy pomiędzy PAP a AK w sprawie scalenia obu organizacji. W sierpniu 1943 roku dokonano masowych aresztowań PAP. Po zatrzymaniach Lesikowski zdołał z częścią okręgu kościerskiego PAP dołączyć do AK. Według niepotwierdzonych informacji miał on kontynuować działalność wywiadowczą, w tym utrzymywać kontakt z wywiadem brytyjskim. W listopadzie 1943 roku został komendantem obwodu AK Kościerzyny.
W nocy z 24 na 25 kwietnia 1944 roku gestapo dokonało kolejnego aresztowania członków PAP. Wśród trzydziestu aresztowanych znalazł się także Lesikowski, którego Niemcy zatrzymali w jego mieszkaniu. Przyczyny jego aresztowania nie są znane. Według hipotez Niemcy otrzymali informację o Lesikowskim za sprawą jednego z wcześniej aresztowanych członków PAP, który załamał się podczas śledztwa, według innej został wydany przez rodzinę jednego z zesłanych do obozu koncentracyjnego Stutthof w odwecie za atak na pociąg w nocy z 8 na 9 czerwca. Według innego źródła gestapo trafiło na ślad Lesikowskiego dzięki odnalezionym w Dąbrowie dokumentom, które pozostawili partyzanci uciekający przed aresztowaniem.