Pochodzenie Podobnie jak w wielu innych kulturach, w japońskich wierzeniach ludowych powstały różne fantazje dotyczące cech płciowych. W tradycyjnych pieśniach pojawiają się przesłanki nie wykluczające zmiany płci, a także kult płci jako symbolizacji bóstw – dōsojin, których płeć nie zawsze była jednoznacznie określona.
Początki thumb|left|300px|Jest to przykładowa ilustracja dwóch najpopularniejszych wariantów futanari, bez jąder (po lewej) i z jądrami (po prawej) Pierwotnie w języku japońskim prawdziwa osoba lub postać o cechach zarówno męskich, jak i żeńskich była nazywana futanari. Zmieniło się to w latach 90., gdy rysowane postacie futanari stały się bardziej popularne w anime i mandze. Obecnie termin ten ogólnie odnosi się do fikcyjnych (narysowanych) żeńskich postaci interseksualnych. Futanari jest również używane jako specyficzny termin gatunkowy dla mediów związanych z hentai (pornograficzne anime i manga) przedstawiających takie postacie. Gatunek ten zyskał również popularność w latach 90.