Megan występowała w musicalu do 28 maja 2006 roku, a jej następczynią została Kate Reinders.
Od września do grudnia 2006 roku Megan Hilty ponownie wcieliła się w rolę Glindy podczas pierwszej trasy krajowej musicalu, zastępując Kendrę Kassebaum. Niedługo potem Hilty po raz pierwszy wcieliła się w tę rolę w przedstawieniu w Los Angeles, którego pokazy przedpremierowe rozpoczęły się 10 lutego 2007 roku, a premiera odbyła się 21 lutego. Megan opuściła produkcję 18 maja 2008 roku i została zastąpiona przez Erin Mackey. Megan powróciła do produkcji 31 października 2008 roku, aby zamknąć produkcję, której ostatni występ odbył się 11 stycznia 2009 roku.
Megan występowała również w musicalu Café Puttanesca w City Theatre w Pittsburgh oraz w przedstawieniu Suds w Oregon Cabaret Theatre.
W listopadzie 2021 roku ogłoszono, że Megan Hilty zagra Lily St. Regis w serialu Annie Live!, zastępując Jane Krakowski, która wycofała się z programu po przełomowym przypadku zakażenia COVID-19.
W 2024 roku Hilty zagrała w teatralnej adaptacji sztuki Ze śmiercią jej do twarzy jako Madeline Ashton, u boku współtwórczyni głównej roli Jennifer Simard jako Helen Sharp. Od 30 kwietnia do 2 czerwca 2024 roku próby przedpremierowe odbywały się w Cadillac Palace Theatre w Chicago.