W 1920 roku Doshisha uzyskała status uniwersytetu i przekształciła się w pełnoprawny uniwersytet w anglo-amerykańskiej tradycji akademickiej. Podczas II wojny światowej budynkom szkoły nadano japońskie nazwy, a z programu nauczania usunięto elementy prozachodnie. Warunki sprzed wojny zostały przywrócone po kapitulacji Japonii. Pierwsze programy studiów podyplomowych uruchomiono w 1953 roku.
Wydział W 2013 roku na kampusach Uniwersytetu Doshisha w Kioto pracowało 777 pracowników naukowych na pełen etat oraz 1411 pracowników naukowych na część etatu. Jeśli chodzi o badania, Doshisha złożyła 36. największą liczbę wniosków patentowych w kraju.
Uniwersytet Doshisha ma dwa główne kampusy: w Imadegawa w centrum Kioto i w Kyotanabe w południowym Kioto. Imadegawa to główny kampus, znajdujący się w dawnej rezydencji Satsuma Domain. Jest on używany od momentu założenia szkoły. Kampus położony jest w centrum Kioto, tuż obok Shōkoku-ji, z widokiem na Pałac Cesarski w Kioto. Pięć budynków na terenie kampusu Imadegawa zostało uznanych za Ważne Obiekty Kultury Japonii, w tym kaplica Doshisha i Clark Memorial Hall. Kampus ten przeznaczony jest przede wszystkim dla studentów wydziałów nauk humanistycznych, biznesu (w tym szkoły podyplomowej biznesu ), teologii i prawa.