Wellera, statut uprawniający do nadawania stopni naukowych. W tym samym roku szkoła zmieniła nazwę na Kolegium św. Ignacego i przeniosła się do nowego budynku przy Van Ness Avenue w Civic Center (obecnie znajduje się tam Davies Symphony Hall). Po trzęsieniu ziemi i pożarze w 1906 roku kolegium przeniesiono na rogi ulic Hayes i Shrader.
Jezuici nabyli niewielki pas ziemi na rogu ulic Fulton Street i Parker Avenue, a w 1914 roku ukończyli budowę obecnego Kościoła św. Ignacego w tym miejscu. Do 1927 roku, aby sprostać rosnącej liczbie studentów, wybudowano budynek tuż na wschód od kościoła, a kolegium przeniosło się na swoją obecną lokalizację. W 1930 roku, z okazji diamentowego jubileuszu i na prośbę grup absolwentów, Kolegium św. Ignacego zostało przemianowane na Uniwersytet San Francisco.
Podobnie jak miasto, które je otacza, USF jest postępowe. USF było jednym z pierwszych rasowo zintegrowanych uniwersytetów w kraju. W 1951 roku, gdy drużyna futbolowa USF została zaproszona do udziału w Orange Bowl pod warunkiem, że pozostawi swoich czarnoskórych zawodników, drużyna odmówiła.
W 1978 roku USF zakupił Lone Mountain, powiększając kampus do 55 akrów.