Przy muzeum urządzono ogród z roślinnością karkonoską.
Po przejściu Dolnego Śląska w granice Polski w 1945, zmieniono nazwę placówki na Muzeum Miejskie im. Jana Matejki, w 1949 na Muzeum Regionalne, a w 1975 na Muzeum Okręgowe, jednak do 1948 włącznie i w latach 1950–1952 nie udostępniano zbiorów publiczności, powiększając jednocześnie zbiory o eksponaty z różnych muzeów i instytucji regionu zachodniosudeckiego. Od 1953 muzeum prowadzi stałą działalność ekspozycyjno-wystawienniczą. Począwszy od 1964 placówka zaczęła się specjalizować w zbiorach artystycznych wyrobów szklanych, a podstawą tej kolekcji stają się eksponaty z Huty Szkła „Julia” z pobliskich Piechowic. W 2001 r. placówka otrzymała współcześnie obowiązującą nazwę – Muzeum Karkonoskie w Jeleniej Górze, a w latach 2009–2011 budynek główny przeszedł remont.
Oprócz głównej siedziby, muzeum ma trzy oddziały: Dom Carla i Gerharta Hauptmannów w Szklarskiej Porębie (ul. 11 Listopada, nr 23) (od 1995) Muzeum Zamek Bolków (ul. Zamkowa 1) (od 1977) Muzeum Historii i Militariów w Jeleniej Górze (ul. Sudecka 81) Muzeum Walki i Pracy w Cieplicach (od 1980;