Do roku 1984 odbywał się tylko jeden wyścig, jednak w 1985 wprowadzo dwie klasy, z czego w jednej z nich wprowadzono ograniczenie maksymalnej liczby psów. Przez kilka lat obie klasy biegały tą samą trasą, która z roku na rok była wydłużana, co okazało się problematyczne dla maszerów posiadających ograniczoną liczbę psów. Od 1992 roku zostały wyznaczone trasy o dwóch różnych długościach, dłuższa (1000 km) dla klasy otwartej oraz krótsza (500 km) dla klasy ograniczonej.
Początkąwym organizatorem była Alta Trekkhundklubb. W 2001 utworzono spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością o nazwie Finnmarksløpet, której głównym akcjonariuszem pozostał Alta Trekkhundklubb.
W 2001 roku wyścig otwierała Marta Ludwika, co przyczyniło się do podniesienia popularności, gdyż wydarzeniem tym zainteresowały się media.
W 2014 roku dodano klasę juniorską dla grupy wiekowej 15–17, w skrócie określaną FL-Junior.
W 2015 do wyścigu w klasie otwartej dodano nowy punkt kontrolny, dzięki czemu wydłużono długość do 1100 km. Wtedy też zawody Finnmarksløpet miały status mistrzostw świata w długodystansowym psim zaprzęgu.