Dalsze etapy fazy pucharowej pozostają bez zmian.
Miejsca dla federacji zostaną rozdzielone poprzez współczynnik ligowy UEFA z sezonu 2023/2024. W edycji 2025/2026 Ligi Konferencji może wziąć udział 161 zespołów (poza zespołami z Rosji, z powodu przeprowadzanej przez nią inwazji na Ukrainę), w tym drużyny wyeliminowane z Ligi Mistrzów UEFA i Ligi Europy UEFA.
Prawo udziału w rozgrywkach uzyskają: Jedna drużyna z federacji zajmującej miejsca od 1 do 12, Dwie drużyny z federacji zajmującej miejsca od 13 do 33 (z wyłączeniem Rosji), Trzy drużyny z federacji zajmującej miejsca od 34 do 50 (z wyłączeniem Liechtensteinu), Dwie drużyny z federacji zajmującej miejsca od 51 do 55, 16 drużyn wyeliminowanych z Ligi Mistrzów UEFA 2025/26, 32 drużyny wyeliminowane z Ligi Europy UEFA 2025/26.
Lp.FederacjaWspół.Drużyny1 104.303 12 90.2843 89.4894 86.6245 66.8316 61.3007 56.3168 48.8009 38.60010 36.05011 36.05012 32.97513 32.600 214 31.62515 31.52516 31.45017 31.12518 28.00019 27.780
Lp.FederacjaWspół.Drużyny20 25.525 221 25.37522 22.965 023 22.100 224 21.87525 21.50026 21.37527 20.37528 20.12529 19.62530 13.25031 13.12532 11.54133 11.50034 11.12535 10.875 336 10.62537 10.625