masa ciała 35–80 g. Myszor sundajski jest małym szczurem, którego cechuje krótkie i kolczaste futro. Włosy na grzbiecie są ciemnorudobrązowe lub mocno ciemnobrązowe, jaśniejsze na bokach i ciemniejsze na grzbiecie, z szarym podszerstkiem i rozległymi sztywnymi kolcami na całej jego długości. Brzuch jest koloru od szarego do pomarańczowoszarego, z szarym podszerstkiem i pomarańczowymi płowymi końcówkami, delikatniejszymi kolcami i nie jest ostro odgraniczony od grzbietu. Każde oko jest otoczone ciemną obwódką. Uszy są stosunkowo długie i brązowoszare; włosy czuciowe również są długie i ciemne. Łapy są koloru białego, długie i wąskie; tylna stopa ma zwykle pięć opuszek kończynowych; bardzo rzadko występuje mała zewnętrzna opuszka śródstopia. Ogon stanowi 85–90% długości głowy i ciała, i jest dwukolorowy, ciemnobrązowoczarny u góry oraz biały u dołu, i na końcu nagi. Czaszka ma małe guzki i krótki otwór podniebienny. Myszor sundajski posiada cztery pary gruczołów mlekowych: jedna piersiowa, jedna pozapachowa i dwie pachwinowe.
Genetyka Diploidalna liczba chromosomów wynosi 2n=36 , przy czym liczba fundamentalna u samic wynosi 72 natomiast u samców 71.