Budynek został zaprojektowany przez japońskiego architekta Aratę Isozakiego we współpracy z Hiszpanem Césarem Portelą. Charakteryzuje się granitowymi murami, ścianami oraz schodami. Fasada zwrócona ku promenadzie morskiej ma zakrzywiony kształt, przypominający żagiel napinany przez wiatr. Jej powierzchnię pokrywa 6 600 elementów z łupka pochodzącego z kamieniołomów w Galicji, w prowincjach Lugo i Ourense, które zostały zamocowane przy użyciu niemal 160 000 ręcznie dokręcanych śrub. Ekspozycja budynku na częste sztormy nawiedzające miasto każdej zimy spowodowała, że w 2022 roku doszło do oderwania niektórych elementów fasady. Aby dopasować budynek do skalistego terenu, na którym go wzniesiono, konieczne było wykucie ponad 30 000 ton kamienia.
Muzeum dysponuje przestrzenią wystawienniczą o powierzchni 1 500 m², obejmującą prawie 200 interaktywnych modułów, które wymagają obsługi przez zwiedzających w celu zrozumienia treści.