Wypadek Lot ANA wystartował z lotniska w Chitose, aby odbyć krajowy lot do Ōta. Po starcie samolot wzniósł się na wysokość przelotową 28 000 stóp (8500m). Tymczasem 22-letni pilot-stażysta i jego 31-letni instruktor ćwiczyli manewry w walce powietrznej w osobnych maszynach. Formacja leciała mniej więcej na tej samej wysokości co lot 58. Kursant nie był świadomy kolizyjnego kursu lotu, aż do momentu otrzymania polecenia od instruktora, aby uciec przed boeingiem, lecz było już za późno. Maszyna wojskowa przednią krawędzią prawego skrzydła uderzyła w lewy statecznik poziomy Boeinga, co spowodowało, że samolot stracił kontrolę, wszedł w stromy lot nurkowy, przekroczył barierę dźwięku i rozpadł się w powietrzu. Wrak lotu 58 spadł w pobliżu miasta Shizukuishi.
Prawe skrzydło myśliwca oderwało się, przez co również wpadł w korkociąg, który uniemożliwił pilocie-stażyście katapultowanie się, więc odpiął pasy bezpieczeństwa i uwolnił się z samolotu, po czym otworzył spadochron i bezpiecznie wylądował na pobliskim polu ryżowym.