25% gatunków roślin i zwierząt na Mauritiusie, jednak poważnie zagraża im obecność gatunków inwazyjnych oraz introdukowanych, takich jak (Psidium cattleianum), ligustr , pielgrzan madagaskarski (Ravenala madagascariensis) i oraz sambar sundajski (Cervus timorensis), makak krabożerny (Macaca fascicularis), zając czarnoszyi (Lepus nigricollis), bilbil zbroczony (Pycnonotus jocosus), dzik (Sus scrofa) czy szczur śniady (Rattus rattus), które konkurują o zasoby z rodzimymi gatunkami. Czynna ochrona tego obszaru polega m.in. na fizycznym usuwaniu roślin inwazyjnych oraz wyłapywaniu zwierząt obcych przy użyciu pułapek.
thumb|Inwazyjne makaki krabożerne (2016) Na terenie Parku Narodowego Black River Gorges występują 163 spośród 311 gatunków roślin endemicznych Mauritiusa. Duża część z nich (ok. 60%) uznawana jest za gatunki zagrożone, m.in. hurma , oraz . Według IUCN maurytyjska flora uchodzi za trzecią pod względem zagrożenia na świecie (po florze Hawajów i Wysp Kanaryjskich).