Szczególnie zachodni naukowcy zwracają uwagę, iż pomimo profesjonalnie przeprowadzonych badań archeologicznych ich wyniki zinterpretowano zgodnie z tradycyjną wizją odwiecznych, jednorodnych Chin, ignorując odkrycia wskazujące na bardziej złożoną wczesną historię regionu. Archeologia została zatem podporządkowana pewnej z góry przyjętej historiografii, zaś ponieważ projekt stał się podstawą do sformułowania nowej obowiązującej historycznej ortodoksji, to pomimo profesjonalizmu wielu zaangażowanych w niego uczonych ostatecznie odegrał rolę hamującą dalszy postęp w badaniach nad wczesną historią Chin.
Założenia projektu U początków projektu stał Song Jian, wysoko postawiony urzędnik, który nadzorował badania naukowe w Chinach. Miał on być zażenowany gdy podczas swojej podróży do Egiptu w 1995 przedstawiono mu dokładną chronologię rządów III dynastii, która rządziła w tym kraju w 2750 p.n.e. To wówczas stwierdził, iż Chińczycy pozostają daleko w tyle w badaniu chronologii panowania swoich pierwszych dynastii i by temu zaradzić, wezwał do stworzenia „Projektu chronologii Xia-Shang-Zhou”. Projekt zatem od początku był motywowany przez nową falę chińskiego nacjonalizmu, zaś jego twórcy „nigdy nie ukrywali swoich podstawowych celów: zaszczepienia dumy i solidarności wśród Chińczyków”.