Regulamin ŻTOS opracowano na przełomie września i października 1940 roku, a zaakceptowano 27 października. 30 października ŻSS–KK została przekształcona w Żydowskie Towarzystwo Opieki Społecznej, a 8 listopada organizacja podporządkowała się Żydowskiemu Komitetowi Opiekuńczemu Miejskiemu. Według biura organizacji znajdowały się w budynku Głównej Biblioteki Judaistycznej oraz przyległych budynkach, po zmniejszeniu obszaru getta biura ŻTOS przeniesiono do lokalu przy ulicy Nowolipki 29 oraz do budynku przy ulicy Przejazd 9.
Od początku działalności ŻTOS Żydowski Komitet Opiekuńczy Miejski podejmował próby podporządkowania sobie kluczowych wydziałów podległych organizacji. 11 stycznia 1941 roku funkcje i personel biura listów zagranicznych przejął Wydział Krewnych Zagranicznych w ŻKOM. W czerwcu 1941 roku ŻKOM podporządkowano Wydział Rejestracyjno-Statystyczny, a trzy miesiące potem również Wydział Zaopatrywania ŻTOS. Latem 1941 roku zarząd nad kuchniami ludowymi w getcie przeszedł w ręce Judenratu, w związku z czym Wydział Kuchen Ludowych podporządkowany został Komisji Dyspozycyjnej przy Judenracie.