Jako minister wojny odpowiadał również za gruntowną reformę wojskowego kodeksu karnego. Usiłował również zreformować przepisy mobilizacyjne z 1868 roku jednak działania te zakończyły się porażką ze względu na silny opór parlamentu węgierskiego. Pitreich gotowy był pójść na ustępstwa wobec Węgrów, aby umożliwić realizację reformy. Doprowadziło to do konfliktu z następcą tronu arcyksięciem Franciszkiem Ferdynandem. Arcyksiąże uniemożliwił Pitreichowi objęcie stanowiska szefa Sztabu Generalnego w 1906 roku i doprowadził do przejścia ministra w stan spoczynku. Zamiast niego szefem Sztabu został Franz Conrad von Hötzendorf. W 1909 roku, już na emeryturze, został nobilitowany przez cesarza Franciszka Józefa. Od 1903 roku był honorowym szefem 63. Pułku Piechoty.