Ofiary Szpital Szuhada al-Aksa oraz Ministerstwo Zdrowia Strefy Gazy poinformowały o co najmniej 33 zabitych Palestyńczykach – w tym 9 dzieciach, 3 kobietach i 21 mężczyznach. UNRWA podała liczbę co najmniej 35 ofiar śmiertelnych. Według Associated Press i świadków cytowanych przez The Guardian, atak był wymierzony w część budynku, w której przebywali mężczyźni i chłopcy; kobiety i dziewczęta znajdowały się w oddzielnej części szkoły. Wśród ofiar znajdowały się również dzieci zabite obok swojej matki. Dokumentacja NPR wskazała na odnalezienie szczątków pięciorga dzieci.
Stanowisko Izraela Izraelska armia oświadczyła, że celem ataku byli bojownicy Hamasu, rzekomo przebywający na terenie szkoły, jednak nie przedstawiono dowodów potwierdzających te zarzuty. IDF podało, że zginęło 20–30 bojowników, publikując nazwiska 17 osób, które uznano za członków Hamasu. Osiem z tych nazwisk nie zgadzało się z rejestrami szpitalnymi, a jedno odnosiło się do ośmioletniego chłopca.