Północne zbocza Margani Wyżnej gwałtownie obrywają się w głęboką dolinę bezimiennego dopływu Kamionki. Południowe stoki, prowadzące ku zabudowaniom Maciejowej, również są strome. Rozcinają je wody kilku potoków, w tym Potoku z Margani. Od zachodu teren wyraźnie opada, natomiast na północnym zachodzie od szczytu odchodzi wyraźne ramię stanowiące przedłużenie całego grzbietu. Rozpościera się ono aż po przysiółek Margań Wyżna i dalej pod Maćkowę. Od wschodu grzbiet prowadzi z kolei ku Sapalskiej Górze, od której Margań oddzielona jest wyraźną, nienazwaną przełęczą.
Nazewnictwo W materiałach źródłowych, w tym na mapach topograficznych, szczyt Margani Wyżnej niekiedy nieprawidłowo oznaczany jest jako Margań Niżna. Wzniesienie takie również istnieje, co więcej, w tym samym paśmie górskim. W innych opracowaniach informacje takie bywają powielane. Niemniej, oba szczyty leżą w odrębnych gminach (Margań Wyżna – w Łabowej, Margań Niżna – w Nawojowej) oraz mają różną wysokość (odpowiednio – 774 lub 776 oraz 737 m n.p.m.). Według danych Państwowego Rejestru Nazw Geograficznych szczytem, który powinien nosić nazwę Margań Wyżna jest tylko i wyłącznie ten leżący w gminie Łabowa.