Water Resources Research, 42(3), które można wykorzystywać celem poprawy jakości wody, stanu ekologicznego ekosystemów wodnych i dobierania oraz projektowania zabiegów renaturyzacyjnych i rewitalizacyjnychWood P.J., Hannah D.M., Agnew M.D. and Petts G.E. 2001. Scales of hydroecological variability within a groundwater-dominated chalk stream. Regulated Rivers: Research and Management, 17, 347–367.. Hydroekologia jest ważna dla zarządzania zasobami wodnymi i ochrony ekosystemów przed skutkami działalności człowieka i zmian klimatycznych. Zasady hydroekologii są wykorzystywane do opracowywania zrównoważonych praktyk gospodarowania wodą, obejmujących m.in. odnowę rzek, kontrolę powodzi, zrozumienia mechanizmów suszy i ekosystemowego podejścia do zasobów wodnychEverard M. 1996. The importance of periodic droughts for maintaining diversity in the freshwater environment. Freshwater Forum, 7: 33–50.