Torfowiska i wilgotne łąki na terenie rezerwatu porastają gatunki wpisane do litewskiej czerwonej księgi gatunków zagrożonych – gnidosz królewski (Pedicularis sceptrum-carolinum), goryczka wąskolistna (Gentiana pneumonanthe), lipiennik Loesela (Liparis loeselii), żłobik koralowy (Corallorhiza trifida), wełnianka delikatna (Eriophorum gracile), fiołek mokradłowy (Viola stagnina), wyblin jednolistny (Malaxis monophyllos), wierzba lapońska (Salix lapponum) i wierzba borówkolistna (S. myrtilloides), bebłek błotny (Lythrum portula) oraz bardzo rzadka skalnica torfowiskowa (Saxifraga hirculus), a oprócz nich także żurawina błotna (Vaccinium oxycoccos), wrzos zwyczajny (Calluna vulgaris), borówka bagienna (Vaccinium uliginosum) i wełnianka pochwowata (Eriophorum vaginatum).
Na powierzchni jezior występują natomiast grzybienie białe (Nymphaea alba) i grzybienie północne (N. candida), rdestnica pływająca (Potamogeton natans) oraz grążel drobny (Nuphar pumila). Brzegi masowo porasta pałka wąskolistna (Typha angustifolia) oraz turzyce: (Carex omskiana), dwustronna (C. disticha) oraz obła (C. diandra).