Kościół Mariacki (niem. Sankt-Marien-Kirche lub Marienkirche) – luterańska świątynia parafialna znajdująca się w niemieckim mieście Flensburg.
Historia Parafię we Flensburgu założono prawdopodobnie w 1182 roku, wkrótce po założeniu miasta. Pierwsza wzmianka o świątyni pochodzi z listu biskupa Aarhus znanego jako z 2 maja 1284, z którego wynika, że rozpoczęto wówczas odbudowę kościoła zniszczonego w 1248 roku. Około 1400 roku gmach wydłużono o dwa przęsła na wschód i wzniesiono kaplice przy nawach bocznych. W latach 1730–1731 wzniesiono wieżę kościelną z barokowym hełmem, w 1780 do jednej z kaplic dobudowano dekorowaną wolutami kruchtę, a w 1788 korpus nawowy przykryto dachem mansardowym. W latach 1878–1880 wzniesiono nową, neogotycką wieżę wg projektu Johannesa Otzena, który wcześniej kierował odbudową wieży pobliskiego kościoła św. Mikołaja we Flensburgu, a w latach 1900–1901 od północy dobudowano zakrystię. W 1906 założono chór kościelny im. Johanna Sebastiana Bacha. Podczas II wojny światowej zniszczonych zostało część witraży, sześć nowych wykonała w latach 1948–1956 miejscowa malarka Käte Lassen. W 1958 od południa do wieży dobudowano kruchtę, służącą od tej pory jako główne wejście do świątyni.