W lipcu 2021 ogłosił swoją kandydaturę w wyborach prezydenckich. 10 października zwyciężył w prawyborach stając się oficjalnym kandydatem Partii Demokratycznej. 10 marca 2021 otrzymał 16 147 738 głosów, co stanowiło 47,83% głosów ważnych. Tym samym przegrał z Yoon Suk–yeol'em. Po przegranej w wyborach prezydenckich w 2022 roku Lee został liderem Partii Demokratycznej. Jego przywództwo przypadło na burzliwy okres polityczny, który zakończył się impeachmentem prezydenta Yoon Suk-yeola w 2024 roku.
10 kwietnia 2025 ogłosił swoją kandydaturę w wyborach prezydenckich, a 27 kwietnia stał się oficjalnym kandydatem z ramienia Partii Demokratycznej. 3 czerwca Lee zwyciężył w wyborach prezydenckich uzyskując 49,42% poparcia. Następnego dnia objął urząd prezydenta Korei Południowej.
Poglądy Lee Jae-myung jest politykiem o wyrazistych poglądach, które ewoluowały na przestrzeni lat, dostosowując się do zmieniającej się sytuacji politycznej i społecznej Korei Południowej. Początkowo kojarzony z progresywnym skrzydłem Partii Demokratycznej, w ostatnich latach przesunął się w stronę centrum, co pozwoliło mu zdobyć szersze poparcie społeczne.