Główna gleba na Hilbre to przede wszystkim bardzo piaszczysta glina. Chociaż nie przeprowadzono szczegółowego badania, rozmieszczenie gatunków roślin wskazuje na szeroki zakres wartości pH. Gleba na Middle Eye była przedmiotem bardziej szczegółowych badań, szczególnie w odniesieniu do pH i przewodności. Składa się częściowo z dobrze przepuszczalnej piaszczystej gliny, a częściowo ze słabo przepuszczalnej, znacznie bardziej torfowej gleby. Zakres pH wynosi od 4,0 do 8,4. Ta zmienność częściowo wyjaśnia dużą różnorodność gatunków roślin występujących na tak stosunkowo małym obszarze. Gleba na Little Eye jest prawie czystym, nawiewanym piaskiem o niskiej zawartości próchnicy i ograniczonym zakresie gatunków roślin.
Flora i fauna Większość powierzchni Hilbre i Middle Eye pokryte jest zbiorowiskami roślin trawiastych, z płatami roślinności wrzosowiskowej z gatunkami takimi jak wrzosiec popielaty (Erica cinerea) i wrzos pospolity (Calluna vulgaris). Po zachodniej stronie wyspy Hilbre i Middle Eye trawy i wrzosowiska ustępują miejsca roślinności szczytów klifów charakterystycznej dla nadmorskich wrzosowisk występujących w zachodniej Wielkiej Brytanii. Do typowych gatunków należą: zawciąg pospolity (Armeria maritima), babka pierzasta (Plantago coronopus), warzucha duńska (Cochlearia danica) i muchotrzew Sperqularia rupicola.