W czerwcu 2019 roku nowo wybrany prezydent Salwadoru Nayib Bukele udał się do graniczącego z Gwatemalą meksykańskiego stanu Chiapas i spotkał się z prezydentem Meksyku Andrésem Manuelem Lópezem Obradorem. Przywódcy obu krajów omówili inicjatywy mające na celu zmniejszenie napływu migrantów z Salwadoru do Meksyku w drodze do Stanów Zjednoczonych oraz zaangażowanie Meksyku w rozwój krajów Ameryki Środkowej. W maju 2022 roku prezydent Meksyku Andrés Manuel López Obrador złożył oficjalną wizytę w Salwadorze.

5 kwietnia 2024 roku ekwadorska policja wkroczyła do ambasady Meksyku w Quito i aresztowała byłego wiceprezydenta , który schronił się tam w grudniu 2023 roku, aby uniknąć kary za ciążące na nim zarzuty korupcyjne. Po szturmie Meksyk zerwał stosunki dyplomatyczne z Ekwadorem. 10 kwietnia atak został potępiony przez Organizację Państw Amerykańskich we wspólnej rezolucji państw członkowskich. Dokument został przyjęty 29 głosami za, jednym głosem przeciw (Ekwador), dwoma nieobecnymi krajami (Wenezuela i Meksyk) i jednym wstrzymującym się (Salwador).