13 października 1936 roku stworzono Wojska Lotnicze i Obrony Przeciwlotniczej, a w Ministerstwie Spraw Wojskowych wyodrębniono Departament do spraw Lotnictwa i Obrony Przeciwlotniczej. Uzyskano w ten sposób dodatkowe fundusze na rozwój lotnictwa. Wówczas projekt samolotu C-36 został skierowany w kierunku budowy prototypu. Z powodu ograniczonej liczby inżynierów prace do listopada 1937 roku praktycznie prowadzone były w bardzo powolnym tempie. Wówczas funkcję głównego konstruktora przejął Jürg Branger. Po dokonaniu zmian w konstrukcji samolotu zmieniono jego oznaczenie z C-3600 na C-3601 i ruszono z budową prototypu pod koniec 1938 roku.
Pierwszy prototyp, C-3601, odbył swój pierwszy lot 15 maja 1939 roku. Osiągnięto prędkość 420 km/h mimo stale wyciągniętego podwozia, które stawiało opór aerodynamiczny. W sierpniu 1939 roku oblatywacz Ernst Wyss przeprowadzał ostatnie próby przed przekazaniem samolotu do prób wojskowych. Po planowanym nurkowaniu z wysokości 3 kilometrów samolot został wyprowadzony do lotu poziomego. W tym momencie podczas przechyłu nastąpiło urwanie się lotek zmuszając pilota do skoku na spadochronie. Samolot rozbił się w następstwie zdarzenia. Drugi prototyp C-3602, który miał mocniejszy silnik wzbił się w powietrze 30 listopada tego samego roku.