Ponadto kilkakrotnie bezskutecznie próbował zakwalifikować się do Main Tour poprzez Q School, jednak nigdy nie udało mu się przejść fazy grupowej 1/8 finału.
W kolejnych latach Thomson odniósł pewne sukcesy na poziomie amatorskim; zaledwie kilka dni po ostatecznej porażce z Shacharem Rubergiem na Mistrzostwach Europy w wariancie 6-Red, dotarł także do półfinału Mistrzostw Europy Seniorów w 2018 roku. W następnym roku ponownie dotarł do finału Mistrzostw Szkocji, które wygrał w 2025 roku po raz drugi w ciągu 24 lat. W 2021 roku po raz pierwszy zdobył mistrzostwo kraju wśród seniorów, a w 2024 roku powtórzył to osiągnięcie.
W lipcu 2025 wziął udział w rankingowym turnieju Championship League Snooker zastępując Lucę Brecela, który wycofał się z turnieju.
Sukcesy Turnieje amatorskie Rezultat Rok Turniej Przeciwnik Wynik Przypisy Finalista 1. 2018 EBSA 6 reds Snooker Championship 1–5 Zwycięzca 1. 2001 Scottish Amateur Championship Ian Wells7–2 Finalista 2. 2002 Scottish Amateur Championship 0–7 Finalista 3. 2003 Scottish Amateur Championship James McBain3–7 Finalista 4. 2014 Scottish Amateur Championship 3–7 Finalista 5. 2019 Scottish Amateur Championship 4–7 Zwycięzca 2.