W sytuacji porażki wyżej notowanej drużyny, przejmie ona współczynnik rywala.
Oznaczenia: Drużyny, które przegrały w I rundzie eliminacyjnej Ligi Mistrzów i zachowały swój współczynnik.
Drużyny, które przegrały w I rundzie eliminacyjnej Ligi Mistrzów i przejęły współczynnik rywala.
Grupa 1 Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. The New Saints F.C.7.500 Levadia Tallinn6.500 Žalgiris Wilno6.000 Drużyny nierozstawione Drużyna Wsp. FC Differdange 035.000 Iberia 19994.500 Linfield F.C.2.993
Grupa 2 Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. Inter Club d’Escaldes7.500 Dynama Mińsk6.000 Milsami Orgiejów5.500 Drużyny nierozstawione Drużyna Wsp. Olimpija Lublana5.500 FK Budućnost Podgorica5.000 Egnatia Rrogozhinë2.500
Pary II rundy kwalifikacyjnej
Pierwsze mecze
Rewanże
III runda kwalifikacyjna Do startu w III rundzie kwalifikacyjnej w ścieżce mistrzowskiej uprawnionych było 8 drużyn (6 z poprzedniej rundy i 2 z I rundy kwalifikacji Ligi Mistrzów, które otrzymały wolny los w poprzedniej rundzie), z czego 4 były rozstawione.