Na początku gry Jesse przybywa do Najstarszej Siedziby w poszukiwaniu swojego brata.
Innymi ważnymi postaciami w Control są: zaginiony szef badań dr Casper Darling (Matthew Porretta), specjalistka ds. badań Emily Pope (), szef ochrony Simon Arish (Ronan Summers), szefowa operacji Helen Marshall (), kierownik Panoptikonu (ang. Panopticon) Frederick Langston (Derek Hagen) oraz tajemniczy fiński woźny Ahti ().
Fabuła W październiku 2019 roku Jesse Faden przybywa do Najstarszej Siedziby po telepatycznej wiadomości od Polaris, szukając miejsca pobytu swojego porwanego brata Dylana. Wewnątrz budynku odkrywa martwe ciało Zachariaha Trencha i zostaje poinstruowana przez Polaris, aby podnieść jego upadłą serwobroń. Broń przenosi ją na Płaszczyznę Astralną, gdzie Zarząd mianuje ją nowym dyrektorem FBK na miejsce Trencha. Opuszczając biuro Trencha, Jesse zostaje zaatakowana przez agentów FBK opętanych przez istotę nazywaną Sykiem (ang. Hiss). Następnie dowiaduje się, że Najstarsza Siedziba została objęta awaryjnym zamknięciem z powodu rozprzestrzenienia się Syku i że wszyscy w budynku zostali nim opętani, z wyjątkiem tych, którzy noszą Wzmacniacze Rezonansu Hedronu (ang. Hedron Resonance Amplifiers – HRA), urządzenia zbudowane przez zaginionego naukowca FBK, dra Caspera Darlinga.