Twórczość Liška współpracował szczególnie z animatorem Janem Švankmajerem, komponując muzykę do kilku jego wcześniejszych filmów krótkometrażowych, takich jak Trumniarnia (1966), Et Cetera (1966), Historia Naturae, Suita (1967), Mieszkanie (1968), Don Juan (1969), Kostnica (1970), Dżabersmok (1971), a później Zamek Otrantski (1979). Muzyka Liški do Historii Naturae, Mieszkania i Kostnicy została również wykorzystana w krótkometrażowym filmie amerykańskich animatorów braci Quay z 1984 roku zatytułowanym Gabinet Jana Švankmajera.
Skomponował również wiele ścieżek dźwiękowych do ważnych filmów fabularnych Czechosłowackiej Nowej Fali, w tym do Sklepu przy głównej ulicy, Małgorzaty, córki Łazarza, Doliny pszczół, Owoce rajskich drzew spożywamy, Palacza zwłok i Ikarii XB 1.
Liška był najczęściej zatrudnianym kompozytorem filmowym w Czechosłowacji w latach 50. i 60. XX wieku. W latach 60. komponował muzykę do ośmiu filmów rocznie, a także do licznych filmów krótkometrażowych.
Oprócz pracy nad filmami fabularnymi Liška napisał muzykę do filmów dokumentalnych o podróżach Hanzelki i Zikmunda, dwunastu filmów Karela Zemana oraz do różnych krótkometrażowych filmów popularnonaukowych.