Zwalczanie Korzenie marchwi ulegają infekcji już w glebie, podczas wzrostu marchwi. Patogeny mogą dostać się do przechowalni także w postaci grzybni i form przetrwalnikowych. Rozwojowi choroby sprzyja duża wilgotność gleby, dlatego też marchew należy uprawiać na glebach lekkich i przepuszczalnych. Istotne jest zmianowanie, gdyż formy przetrwalnikowe grzyba mogą w glebie przetrwać kilka lat. Z tego względu na polu, na którym wystąpiła rizoktonioza marchwi przez dwa lata nie należy uprawiać roślin korzeniowych, takich jak: burak, seler, marchew, pietruszka, nie zalecane są także ziemniaki, pomidory, papryka, groch, fasola, łubin, wyka, peluszka. Bardzo ważne jest staranne planowanie zabiegów ochrony, chodzi tu o wybranie optymalnego terminu opryskiwań fungicydami uwzględniając progi szkodliwości. Należy unikać przenawożenia azotem oraz uprawiania marchwi na polu w pierwszym roku po oborniku. Bardzo ważny jest zbiór marchwi. Należy go przeprowadzać, gdy gleba jest sucha, tak, by korzenie uległy jak najmniejszemu zniszczeniu;