Od 2001 roku jest związany z Uniwersytetem Przyrodniczym w Poznaniu (UPP), początkowo z Wydziałem Technologii Drewna, a od roku 2020 z Wydziałem Leśnym i Technologii Drewna. W latach 2012–2023 pełnił funkcję Pełnomocnika Rektora UPP ds. Osób Niepełnosprawnych oraz kierownika Zespołu Badawczo-Dydaktycznego Podstaw Konstrukcji Maszyn Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu. Od 2023 roku wykłada również na Politechnice Poznańskiej na Wydziale Inżynierii Zarządzania.
Działalność badawcza i dydaktyczna Profesor Maciej Sydor prowadzi badania koncentrujące się na nowoczesnych materiałach drzewnych, technologiach obróbki drewna oraz zagadnieniach ergonomii, szczególnie w przemyśle meblarskim. Jego dorobek inżynierski obejmuje liczne patenty na wynalazki i wzory użytkowe, a także sześć recenzowanych monografii naukowych i podręczników akademickich. Jest autorem i współautorem ponad 200 artykułów naukowych i innych publikacji.
Jako dydaktyk, prowadzi zajęcia ze wspomagania projektowania (CAD) oraz rysunku technicznego.