W tym samym roku udało mu się zrewanżować za porażkę, pokonując Edwina Figueroę 16 listopada na UFC 167.
7 czerwca 2014 roku Pérez zmierzył się z Bryanem Carawayem na UFC Fight Night 42, jednak przegrał walkę przez poddanie w drugiej rundzie.
Powrót do klatki po rocznej przerwie spowodowanej kontuzją miał odbyć się 21 listopada 2015 roku na UFC Fight Night 78 w jego rodzinnym Meksyku, gdzie Pérez miał zmierzyć się z Damianem Stasiakiem. Stasiak został jednak wycofany z walki i zastąpiony przez Taylora Lapilusa. Walka zakończyła się zwycięstwem Goyito.
30 lipca 2016 roku Pérez zmierzył się z Francisco Riverą na UFC 201, odnosząc kolejne zwycięstwo przez jednogłośną decyzję. W listopadzie tego samego roku odniósł kolejne zwycięstwo przez jednogłośną decyzję, tym razem pokonując Felipe Arantesa na gali UFC Fight Night 98.
W 2017 roku UFC rozwiązało kontrakt z Pérezem, kończąc pięcioletnią współpracę.
Combate Americas 15 marca 2018 roku ogłoszono, że Pérez zmierzy się z bokserem Davidem „DJ” Fuentesem.