Wychowanie morskie Ośrodek organizował obozy młodzieżowe, rejsy wychowawcze i współpracował z organizacjami kształcącymi młodych żeglarzy. Po reaktywacji terenów portowych część tej misji przejęły działania realizowane przez Marinę Trzebież oraz instytucje społeczne, m.in. programy związane z edukacją morską młodzieży.
Flota i jachty COŻ był armatorem wielu jednostek używanych zarówno do szkoleń podstawowych, jak i do żeglugi pełnomorskiej.
Żaglowce s/y „Zew Morza” – żaglowiec szkolny wykorzystywany przez PZŻ, często związany z działalnością ośrodka. s/y „Henryk Rutkowski” / „Kapitan Głowacki” – jedna z najbardziej rozpoznawalnych jednostek szkolnych, przez lata stacjonująca w Trzebieży. s/y „Pogoria” – we wczesnym okresie eksploatacji współpracowała z ośrodkami szkolenia PZŻ, w tym z Trzebieżą.
Jachty pełnomorskie Wśród jachtów szkoleniowych wykorzystywanych przez COŻ znajdowały się m.in:
s/y „Kapitan Haska” – jednostka klasy Opal (Conrad 45).