W 2013 roku, podczas reorganizacji Instytutu jej sekcję przeniesiono do Laboratorium Immunogenetyki.
W 2015 roku Matzinger nagrała ośmioczęściową serię wykładów dotyczącą modelu zagrożenia w immunologii, obejmującą tematy, takie jak odrzucanie przeszczepów, nowotwory, autoimmunizacja, limfocyty T, pasożyty oraz alarmowe sygnały komórkowe.
Praca naukowa Model rozróżniania antygenów przez układ odpornościowy na "obce" i "nie-obce", zaproponowany przez Macfarlane’a Burneta i Franka Fennera w 1949 roku, zaczął napotykać trudności w latach 80. Immunolodzy zauważyli, że limfocyty T są zależne od komórek prezentujących antygen, które muszą nie tylko pokazać materiał, ale też wysłać sygnały kostymulujące. Pod wpływem pism Thomasa Kuhna o zmianach paradygmatów, Charles Janeway zaproponował w 1989 roku, że to wrodzony układ odpornościowy pełni rolę właściwego strażnika odpowiedzi immunologicznej. Teoria rozpoznawania wzorców Charlesa Janewaya zakłada, że układ odpornościowy wykrywa zakażenia dzięki ograniczonej liczbie receptorów rozpoznających wzorce (PRR). Receptory te wiążą charakterystyczne związki chemiczne – takie, które są wspólne dla całych grup patogenów, a nieobecne w komórkach gospodarza (tzw.