4 kwietnia 2005 założył nową partię – Sojusz na rzecz Przyszłości Austrii (BZÖ), a 7 kwietnia został z tego powodu wykluczony z FPÖ. Przez swoich przeciwników Haider był oskarżany o populizm, antysemityzm i ksenofobię oraz konflikty z mniejszością słoweńską w Karyntii. Jörg Haider był również przeciwnikiem uczestnictwa Austrii w Unii Europejskiej oraz wprowadzenia wspólnej waluty euro.
Zginął w wypadku samochodowym w nocy z 11 na 12 października 2008 – podczas próby wyprzedzania uderzył w betonowy słup, po czym kilkukrotnie koziołkował. W chwili wypadku miał 1,8 promila alkoholu we krwi, a licznik jego służbowego Volkswagena Phaeton zatrzymał się z prędkością 142 km/h, gdy dopuszczalna prędkość w miejscu zdarzenia wynosiła 70 km/h. Jego pogrzeb odbył się 18 października. Zwłoki zostały skremowane i pochowane w Dolinie Niedźwiedziej w Karyntii. W toku śledztwa okazało się, że wracał z gejowskiego klubu w Klagenfurcie. 22 października wiceprzewodniczący BZÖ, Stefan Petzner, wyznał, że miał wieloletni romans z Haiderem.