Od 2004 pełnił funkcję konsultanta wojewódzkiego w dziedzinie ginekologii onkologicznej dla województwa małopolskiego. W maju 2014 został powołany na stanowisko konsultanta krajowego w dziedzinie ginekologii onkologicznej, które sprawował do początku 2021, kiedy został zastąpiony przez Mariusza Bidzińskiego. Jako konsultant krajowy koordynował m.in. prace nad aktualizacją programu specjalizacji w ginekologii onkologicznej oraz nad wykazem zalecanego piśmiennictwa dla lekarzy szkolących się w tej dziedzinie. Jest członkiem zespołu ekspertów do spraw onkologii Województwa Małopolskiego, uczestnicząc w tworzeniu regionalnej polityki zdrowotnej w zakresie profilaktyki, diagnostyki i leczenia nowotworów. W 2019 został powołany w skład Krajowej Rady Onkologicznej, organu doradczego ministra zdrowia w sprawach polityki onkologicznej.

Kojs sprawuje patronat naukowy nad cykliczną konferencją „Postępy w ginekologii onkologicznej", odbywającą się m.in. w Zakopanem i Krynicy, poświęconą najnowszym kierunkom diagnostyki i terapii nowotworów narządu rodnego. Jako krajowy konsultant i wykładowca bierze udział w konferencjach i spotkaniach edukacyjnych poświęconych profilaktyce raka szyjki macicy i innych nowotworów ginekologicznych, zwracając uwagę m.in.