Kościół farny św. Michała (niem. Stadtkirche St. Michael) – późnogotycka świątynia luterańska znajdująca się w niemieckim mieście Jena.
Historia Romański kościół wzniesiono na przełomie XI i XII wieku. W XIII wieku na jego miejscu powstał prawie dwukrotnie większy kościół, o długości 36 m i szerokości 11,5 m. Około 1380 roku rozpoczęto budowę trzeciego historycznie kościoła, połączonego z sąsiednim klasztorem cysterek (wzmiankowanym po raz pierwszy w 1301 roku). Korpus nawowy wzniesiono w latach 1474–1557, a wieżę w latach 1489–1556. Mistrzem budowlanym był . W latach 70. XVIII wieku kościół od zewnątrz przebudowano w stylu barokowym. Gmach został uszkodzony wskutek bombardowania 19 marca 1945, konsekrowano go po odbudowie 2 kwietnia 1955. W 2000 roku zrekonstruowano renesansowy hełm wieży, który 16 czerwca 2001 uroczyście zwieńczono krzyżem. W 2005 roku ukończono odbudowę dachu mansardowego.
Architektura i wyposażenie Świątynia późnogotycka, trójnawowa, o układzie halowym, z barokowym dachem mansardowym i renesansowym zwieńczeniem wieży. W północnej nawie wznosi się empora, służąca pierwotnie cysterkom z sąsiedniego klasztoru.