w północnej przeważają tropikalne wilgotne lasy nizinne, które przechodzą w tropikalne lasy suche występujące na południu. Większość drzew liczy mniej niż 100 lat, lecz pojedyncze okazy w północnej części parku narodowego mogą mieć ponad 500 lat (stan na 2003 rok). Wykazano tu występowanie ok. 1300 gatunków roślin, w tym ok. 300 gatunków drzew.
Park Narodowy Soberanía jest jednym z najłatwiej dostępnych parków narodowych w Panamie. Przez jego obszar przebiega 6 szlaków turystycznych, w tym XVI-wieczny, zbudowany przez Hiszpanów szlak kolonialny prowadzący przez Przesmyk Panamski.
Fauna thumb|left|Aguti środkowoamerykański (2019) Na terenie parku narodowego wykazano występowanie 36 gatunków ryb słodkowodnych, 55 gatunków płazów, 79 gatunków gadów, 525 gatunków ptaków oraz 105 gatunków ssaków. Pierwszą grupę kręgowców reprezentuje m.in. , spośród płazów występują tu m.in. ropucha aga (Bufo marinus) oraz , żyjącymi na terenie parku gadami są m.in.