Flotylli U-Bootów, operując z Kilonii.
Pierwszy rejs bojowy i utrata okrętu 24 sierpnia 1941 roku U-207 wyszedł z Trondheim, udając się na swój pierwszy wojenny patrol na Ocean Atlantycki. W dniach 27 sierpnia – 11 września okręt wchodził w skład wilczego stada . 11 września o godzinie 02:45 na wschód od przylądka Farvel okręt storpedował płynący w konwoju zbudowany w 1928 roku brytyjski parowiec „Stonepool” o pojemności 4803 BRT, który przewoził ładunek 7000 ton zboża, 528 ton owsa i ciężarówki o masie 115 ton na trasie Montreal – Sydney – Avonmouth. Jednostka zatonęła na pozycji , a z przebywających na jej pokładzie 49 osób zginęły 42 (kapitan Joseph Hewitson Nicholson, 33 członków załogi i ośmiu artylerzystów). Sześciu członków załogi i jeden artylerzysta zostali uratowani przez kanadyjską korwetę . Pięć minut później wystrzelone przez U-Boota torpedy trafiły także w zbudowany w 1919 roku brytyjski parowiec „Berury” o pojemności 4924 BRT, transportujący ładunek 2100 ton drobnicy z przez Sydney do Belfastu. Ciężko uszkodzony statek został dobity ogniem artyleryjskim przez okręty eskorty na pozycji .