Od 1940 roku kontrolę nad organizacją przejął związek Cotton Bowl Athletic Association, który podpisał umowę z (SWC), aby jedną z drużyn biorącą udział w meczu był właśnie zwycięzca konferencji SWC. Przeciwnikiem była drużyna z drugiego lub trzeciego miejsca z Southeastern Conference (SEC). Czasami też zdarzały się występy drużyn spoza wspomnianych konferencji. Układ ten trwał do 1995 roku. W 1996 roku doszło do rozwiązania SWC i powołania (XII). Od 1999 roku do 2014 roku w Cotton Bowl rywalizował przedstawiciel Big 12 oraz drużyna z SEC.
Od 2010 roku mecze Cotton Bowl są rozgrywane na AT&T Stadium w Arlington. Od 2014 roku Cotton Bowl jest jednym z sześciu głównych meczów pucharowych futbolu akademickiego, które są jednocześnie ćwierćfinałowymi i półfinałowymi spotkaniami turnieju College Football Playoff.
Wyniki Cotton Bowl L.p.DataDrużynyUwagi11 stycznia 193716TCU Horned FrogsMarquette Golden Avalanche621 stycznia 193828Rice OwlsColorado Buffaloes1432 stycznia 193920St.