KSeF został uruchomiony 1 stycznia 2022 jako system dobrowolny na mocy ustawy z 29 października 2021. Zainteresowanie było znikome – w ciągu pierwszego roku przesłano do systemu ok. 22 tys. faktur.
Na mocy ustawy z 16 czerwca 2023 system miał stać się obowiązkowy od 1 lipca 2024 roku. Po zmianie rządu nowy minister finansów Andrzej Domański zlecił zewnętrzny audyt informatyczny. Na podstawie wyników audytu podjęto decyzję o przebudowie systemu od podstaw i przesunięciu terminu na 1 lutego 2026.
Harmonogram DataZakres 1 lutego 2026 Wystawianie: firmy o sprzedaży powyżej 200 mln zł (2024). Odbieranie: wszyscy podatnicy. 1 kwietnia 2026 Wystawianie: wszyscy pozostali podatnicy VAT (czynni i zwolnieni). 1 stycznia 2027 Wystawianie: najmniejsze podmioty (sprzedaż do 10 tys. zł/mies.).
Obowiązek nie obejmuje m.in. podatników bez siedziby w Polsce oraz faktur w ramach unijnych procedur szczególnych.
Praktyczne kwestie związane z wdrożeniem