Rozwój i integracja z Grupą Asseco Do 1997 roku firma WA-PRO rozwinęła się w strukturę posiadającą własną siedzibę, serwis pomocy technicznej oraz sieć wdrożeń i sprzedaży. W 2006 roku WA-PRO weszło w skład Grupy Kapitałowej Asseco, jednego z największych dostawców oprogramowania własnego w Europie Środkowo-Wschodniej. W czerwcu 2007 roku nastąpiło połączenie WA-PRO z firmą Asseco Business Solutions, gdzie marka Wapro dołączyła do portfolio firm takich jak ANICA System, Safo, Softlab oraz Incenti.
Rozwój produktu W 2017 roku programy zaczęły funkcjonować pod jednolitą nazwą Wapro ERP. Od 2018 roku Asseco Business Solutions wzmocniło swoją pozycję poprzez połączenie z firmą Macrologic S.A. Do końca pierwszej dekady XXI wieku firma sprzedała ponad 100 000 licencji oprogramowania30 lat marki Wapro – sukces dzięki użytkownikom. Wapro.pl. Dostęp: 2024. https://wapro.pl/aktualnosci-wapro/30-lat-marki-wapro-sukces-dzieki-uzytkownikom/.. Według danych z 2015 roku, Asseco Business Solutions sprzedało łącznie 210 tysięcy licencji oprogramowania marki Wapro przeznaczonego dla sektora małych i średnich przedsiębiorstwAsseco BS sprzedało 210 tys. licencji oprogramowania dla MSP. Ksiegowosc.org. Dostęp: 2024. https://www.ksiegowosc.org/artykuly/szczegoly/12203_asseco-bs-sprzedalo-210-tys-licencji-oprogramowania-dla-msp..